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签订就业协议书要遵循以下程序：
第一步，由乙方，即由毕业生填写的自己的相关消息。要如实填写，要与毕业生资格审查时认定的信息资料相一致。其中专业名称必须与学校设置的专业名称完全一致，不能简写。填写后交给甲方。
第二步，由甲方，即由用人单位填写相关信息和签署约定条款。用人单位信息中的单位名称要与用人单位有效印鉴上的名称一致;档案转寄地址，要写清楚用人单位的人事保管单位的全称和地址，无人事档案保管权的单位应填写其委托保管档案的地址;入户地址，即户口迁移地址，要明确填写;双方约定的条款细则要写清晰具体：“用人单位或人事部门签章”，不得缺项。
第三步，用人单位上级主管部门或用人单位所属地人力资源部门签章。此项签章主要是为档案寄存和户口迁移之用。公有制单位通常有上级主管部门，但这里所指的“上级主管部门”是指享有进人指标和户口指标的省一级单位或政府所在地的中央直属单位，是以下单位的主管部门通常没有进人户口指标。非公有制单位的上级主管部门通常是指管理其单位员工人事关系的政府所属人力资源服务机构。因此，只要牵涉到毕业生户口档案关系转移的，都要到人力资源管理部门或其授权委托的部门签章，并办理接收函。
第四步，见证方签署意见，即系和学校签署意见。毕业生与用人单位在“四方协议”上签字盖章。协议已经成立，系和学校签证是为了保障毕业生的权益和监督协议双方守约，也是为了办理毕业生报到证和落实毕业生户口档案事项。毕业生必须将签好的就业协议书送回系里签署意见，后送校大学生就业指导中心审核并盖章。目前，如果不牵涉户口转移而内容有合法的，由系里签署意见就可以。在毕业生就业形势严峻和毕业生实习分散又有《劳动合同法》制约的特殊情况下，为了方便毕业生，有时系和学校先在四方协议上签了章。
第五步，“四方协议”由系和学校盖章登记后，学校留取一份，毕业生要将一份送交系里，一份送人事单位，一份由毕业生自己留存。如果毕业生在外地实习，可将签好的就业协议书的第三联邮寄给系里。
附：
三方就业协议书
毕业生：______
用人单位：_________
学校名称：____________
按《普通高等学校毕业生就业工作暂行规定》的要求，为维护国家就业计划的严肃性，明确毕业生、用人单位、学校三方在毕业生就业工作中的权利和义务，经协商，毕业生、用人单位、学校三方签订如下协议：
一、毕业生应按国家有关规定就业，向用人单位如实介绍自己的情况，了解单位的使用意图，表明自己的就业意见，在规定的时间内到用人单位报到，若遇到特殊情况不能按时报到，需征得用人单位的同意。
二、用人单位要如实介绍本单位的情况，明确对毕业生的要求及使用意图，做好各项接收工作。凡取得毕业生资格的毕业生，用人单位不得以学习成绩为由提出违约;未取得毕业资格的结业生，本协议无效。
三、学校要如实向用人单位介绍毕业生的情况，做好推荐工作，用人单位同意录用后，经学校审核列人建议就业计划，报教育厅批准，学校负责办理派遣手续。
四、学校应在学生毕业前安排体检，不合格者不派遣。如果用人单位对毕业生身体条件有特殊要求，原则上在签订协议前进行单独体检，否则，以学校体检为准。
五、毕业生、用人单位、学校三方如有其他约定，应在备注栏注明，并视为本协议的一部分。
六、本协议经毕业生和用人单位签字或盖章后生效。经学校鉴证登记后作为签发报到证的依据。
七、本协议一式三份，毕业生、用人单位、学校各执一份，复印无效。
甲方(用人单位盖章)：
年月日
签订地点
乙方(院方盖章)：
年月日
签订地点
丙方(学生签字)：
年月日
签订地点